MATK & ITS

MatK & Its – là hai vùng DNA thường được sử dụng làm “marker phân tử” để nhận dạng loài và nghiên cứu quan hệ tiến hóa (phylogeny) của thực vật. matK = maturase K. Đây là một gen nằm trong DNA lục lạp (chloroplast DNA) của thực vật.
MatK = maturase K Đây là một gen nằm trong DNA lục lạp (chloroplast DNA) của thực vật. Kích thước khoảng 1.500 bp. Mã hóa protein maturase K, liên quan đến quá trình xử lý RNA trong lục lạp. Có tốc độ tiến hóa tương đối nhanh so với nhiều gen lục lạp khác. Vì vậy, matK rất hữu ích để phân biệt các loài và xây dựng cây phát sinh chủng loại. DNA lục lạp → gen matK → trình tự DNA → so sánh giữa các loài → suy ra quan hệ tiến hóa.
ITS = Internal Transcribed Spacer → vùng đệm được phiên mã bên trong. ITS nằm trong DNA ribosome (rDNA), thường được nghiên cứu dưới dạng 18S rRNA – ITS1 – 5.8S rRNA – ITS2 – 28S rRNA. Trong đó ITS1 + 5.8S + ITS2 thường được gọi chung là vùng ITS. Khác với matK, ITS nằm trong DNA nhân (nuclear DNA).